Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpardP35396 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpardP35396 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpardP35396 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpardP35396 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpardP35396 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpardP35396 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpardP35396 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpardP35396 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpardP35396 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpardP35396 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpardP35396 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpardP35396 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpardP35396 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpardP35396 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpardP35396 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpardP35396 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpardP35396 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpardP35396 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpardP35396 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpardP35396 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PpardP35396 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpardP35396 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpardP35396 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpardP35396 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpardP35396 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpardP35396 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpardP35396 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpardP35396 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpardP35396 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpardP35396 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PpardP35396 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PpardP35396 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms