Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms