Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa3P35173 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms