Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pola1P33609 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pola1P33609 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola1P33609 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola1P33609 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pola1P33609 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pola1P33609 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola1P33609 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola1P33609 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pola1P33609 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola1P33609 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola1P33609 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms