Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd1P33215 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd1P33215 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd1P33215 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd1P33215 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd1P33215 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd1P33215 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd1P33215 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nedd1P33215 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd1P33215 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd1P33215 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd1P33215 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd1P33215 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms