Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Saa4P31532 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Saa4P31532 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms