Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc10P31257 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc10P31257 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms