Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms