Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col2a1P28481 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col2a1P28481 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms