Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjc1P28229 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms