Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Xrcc5P27641 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Xrcc5P27641 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Xrcc5P27641 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Xrcc5P27641 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Xrcc5P27641 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Xrcc5P27641 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Xrcc5P27641 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc5P27641 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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