Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpbP27048 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpbP27048 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpbP27048 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpbP27048 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpbP27048 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpbP27048 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpbP27048 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpbP27048 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms