Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms