Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChgaP26339 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChgaP26339 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
ChgaP26339 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms