Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myf5P24699 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myf5P24699 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myf5P24699 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myf5P24699 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myf5P24699 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myf5P24699 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myf5P24699 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms