Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ntf3P20181 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms