Protein–RNA interactions for Protein: P20060

Hexb, Beta-hexosaminidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexbP20060 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HexbP20060 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HexbP20060 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HexbP20060 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HexbP20060 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HexbP20060 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HexbP20060 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HexbP20060 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HexbP20060 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HexbP20060 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HexbP20060 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HexbP20060 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HexbP20060 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HexbP20060 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HexbP20060 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HexbP20060 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HexbP20060 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HexbP20060 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HexbP20060 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HexbP20060 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HexbP20060 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HexbP20060 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HexbP20060 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms