Protein–RNA interactions for Protein: P12815

Pdcd6, Programmed cell death protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6P12815 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6P12815 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6P12815 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms