Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr4a1P12813 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms