Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa1P11477 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms