Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a1P11087 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a1P11087 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms