Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Schip1P0DPB4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms