Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c1P0CW02 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms