Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms