Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms