Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtaP09225 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtaP09225 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtaP09225 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtaP09225 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtaP09225 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtaP09225 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtaP09225 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtaP09225 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtaP09225 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LtaP09225 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LtaP09225 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms