Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms