Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col3a1P08121 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col3a1P08121 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms