Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Egr1P08046 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Egr1P08046 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egr1P08046 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egr1P08046 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egr1P08046 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms