Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms