Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh1P04444 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh1P04444 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh1P04444 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hbb-bh1P04444 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh1P04444 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms