Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb1P04230 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms