Protein–RNA interactions for Protein: P01806

Ig heavy chain V region 441, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01806 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01806 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01806 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01806 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01806 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01806 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01806 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01806 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01806 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01806 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms