Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01673 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01673 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01673 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01673 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01673 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01673 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01673 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01673 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01673 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01673 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01673 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01673 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01673 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01673 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01673 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01673 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01673 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01673 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01673 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01673 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01673 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01673 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01673 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01673 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01673 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01673 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01673 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
P01673 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01673 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01673 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01673 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
P01673 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01673 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01673 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01673 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01673 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01673 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01673 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01673 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01673 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01673 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01673 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01673 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01673 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01673 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01673 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01673 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01673 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
P01673 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01673 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01673 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01673 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01673 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms