Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01649 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01649 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01649 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01649 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01649 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01649 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01649 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01649 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01649 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01649 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01649 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01649 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01649 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01649 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01649 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P01649 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01649 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01649 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms