Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccl20O89093 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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