Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Setdb1O88974 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setdb1O88974 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms