Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JtbO88824 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JtbO88824 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JtbO88824 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JtbO88824 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JtbO88824 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JtbO88824 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JtbO88824 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JtbO88824 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JtbO88824 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JtbO88824 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JtbO88824 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JtbO88824 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JtbO88824 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JtbO88824 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JtbO88824 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JtbO88824 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JtbO88824 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JtbO88824 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JtbO88824 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JtbO88824 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JtbO88824 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JtbO88824 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JtbO88824 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
JtbO88824 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JtbO88824 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JtbO88824 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JtbO88824 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JtbO88824 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JtbO88824 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JtbO88824 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JtbO88824 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JtbO88824 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JtbO88824 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JtbO88824 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JtbO88824 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JtbO88824 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JtbO88824 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JtbO88824 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms