Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfdp1O88271 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms