Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm10226O88253 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm10226O88253 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm10226O88253 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm10226O88253 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm10226O88253 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gm10226O88253 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10226O88253 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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