Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx2O70340 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nptx2O70340 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms