Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx1O70263 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx1O70263 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms