Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2a2O55143 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms