Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap1O55125 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms