Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlkO54988 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SlkO54988 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SlkO54988 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SlkO54988 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SlkO54988 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SlkO54988 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SlkO54988 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SlkO54988 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SlkO54988 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SlkO54988 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SlkO54988 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SlkO54988 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SlkO54988 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SlkO54988 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SlkO54988 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SlkO54988 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SlkO54988 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SlkO54988 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SlkO54988 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SlkO54988 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SlkO54988 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlkO54988 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlkO54988 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlkO54988 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlkO54988 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlkO54988 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlkO54988 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlkO54988 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlkO54988 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlkO54988 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlkO54988 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlkO54988 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SlkO54988 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SlkO54988 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SlkO54988 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SlkO54988 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SlkO54988 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SlkO54988 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlkO54988 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SlkO54988 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SlkO54988 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SlkO54988 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SlkO54988 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SlkO54988 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms