Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf12O54907 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms