Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sp100O35892 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sp100O35892 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp100O35892 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Sp100O35892 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Sp100O35892 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Sp100O35892 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp100O35892 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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