Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CaluO35887 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CaluO35887 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CaluO35887 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CaluO35887 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CaluO35887 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CaluO35887 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CaluO35887 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CaluO35887 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CaluO35887 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CaluO35887 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CaluO35887 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CaluO35887 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CaluO35887 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms