Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kpna3O35344 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna3O35344 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms