Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkd2O35245 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms